為了充分利用生物工程過程的潛力，在該過程的各階段 所用的培養基成分調配得很合適是十分重要的。這些階段包括有:接種菌的制備、各子培養、后的生產階段。
生物體的特異性需要，易于在實臉室水平上加以確定，然 后再放大成生產水平。在使用大規模發發酵罐時，要特別強調選 用配料，配料應淺是易于得到的、能再生的、穩定的和易于 管理和貯存的。在所有這一切中，配料的價格又起很主要的 作用，因為生物工程過程成功與否，在很大程度上決定于此 過程與生產同一產品的其他方法相比較經濟效益如何?此 外，因為世界商品價格十分不穩定,所以設 計培養基必須善于選用配料。
許多生物工程的原料需用量很大，必須特別注意貯存以 防發生化學變化和微生物污染。
工作人員的健康也必須特別注意，尤其是在處理粉狀物 時。配制培養基是不大讓人感興趣的工作，可是這是全部操 作過程的基礎 ,培養基設計得不好會導致生物生長效率低以 及隨之而來的產物形成得少。
由于大多數發酵過程是用單一的純培養微生物的方法， 因此在發酵中的所有培養基必須沒有其他微生物污染。工業 培養基普遍使用的滅菌方法是在加壓下用蒸氣加熱。培養基 滅菌要求做到培養基成份受到的處理是溫和的，而又能將所 有不需要的微生物全部除掉。